MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16C

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021516	CTTT	2	8	1155	1162	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021516	TGT	2	6	1182	1187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021516	TCA	2	6	1235	1240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021516	TCT	2	6	1281	1286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021516	TTAACT	2	12	1294	1305	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021516	ATT	2	6	1382	1387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021516	TTA	2	6	2794	2799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021516	ATTT	2	8	2800	2807	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021516	C	7	7	3114	3120	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10	NC_021516	TAC	2	6	3126	3131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021516	CTT	2	6	3173	3178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021516	TGAC	2	8	4453	4460	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021516	AC	3	6	4459	4464	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021516	AG	3	6	4476	4481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021516	ATTTG	2	10	4492	4501	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021516	CTAA	2	8	4527	4534	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021516	CATT	2	8	4544	4551	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021516	T	6	6	4613	4618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021516	AAC	2	6	4626	4631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021516	A	6	6	4632	4637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021516	GTT	2	6	4889	4894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021516	TA	3	6	6690	6695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021516	A	6	6	6739	6744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021516	TTTC	2	8	6810	6817	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021516	ACC	2	6	6879	6884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_021516	AGT	2	6	6967	6972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021516	CTTA	2	8	7012	7019	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021516	TCT	2	6	7051	7056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021516	GAA	2	6	7068	7073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021516	ATCA	2	8	7135	7142	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021516	A	6	6	7189	7194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021516	A	6	6	7196	7201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021516	CAGTT	2	10	7259	7268	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_021516	CAT	2	6	9559	9564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021516	TATT	2	8	9572	9579	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021516	ATCTA	2	10	9601	9610	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_021516	TCA	2	6	10990	10995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021516	ATT	3	9	11007	11015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021516	GGT	2	6	11135	11140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021516	ATTG	2	8	11261	11268	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021516	A	8	8	11290	11297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021516	TTA	2	6	11327	11332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021516	CTTTG	2	10	12795	12804	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_021516	GTT	2	6	12817	12822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021516	AAC	2	6	12878	12883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021516	C	6	6	15454	15459	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_021516	TCC	2	6	19367	19372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_021516	CCT	2	6	25936	25941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_021516	CGTT	2	8	27242	27249	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_021516	TGTT	2	8	27271	27278	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.